La sede Baldomero Sanín Cano fue fundada como escuela en el año 1961 con el nombre Instituto de  María y en el año 1962 tomó el nombre de Anexa Baldomero Sanín  Cano, para hacer reconocimiento a este ilustre hombre nacido en el municipio de Rionegro.

Por Resolución Departamental 4309 del 15 de Mayo de 2003 se fusiona con la I.E.J.M.G